胃肠镜检查是消化科的常见检查项目，胃镜检查是借助一条直径约一公分的黑色塑胶包裹导光纤维的细长软管，由嘴中伸入受检者的食道→胃→十二指肠，让医师从显示器上清楚地观察上消化道内各部位的健康状况。必要时，可由胃镜上的小洞伸入夹子做切片检查。全程检查时间约10分钟。这是一种最直观的发现胃肠道病变的方法，同时可以通过内镜操作各种微创手术，包括息肉切除，消化道早癌的切除等等。

      普通胃镜检查，由于胃镜需从咽喉部进入食道，这时多有恶心感，这也是大多数患者感到痛苦的根源。检查前可以通过含服局麻药物，应用镇静药物来减轻不适感。对于实在无法耐受检查的患者，可以选择无痛胃镜，即在检查前静脉注射全麻药物，让患者处于全身麻醉状态，在麻醉师的全程监护下完成操作，安全有保障，病人没有丝毫感觉，内镜医师也能更加从容的完成检查。近年来，随着医疗技术的发展，内镜设备也越来越丰富多样，除了普通胃肠镜，还出现了超声内镜，小肠镜，胶囊内镜以及磁控内镜等，拓宽了诊治手段，不是丰富了医生的“武器库”，也让老百姓可以得到更有针对性的治疗。

      肠镜检查同样也是利用一条末端装有光源和微型摄影机的纤维软管，由肛门慢慢进入结肠，以检查大肠部位的病变。因为人体的下消化道更长，所以与胃镜相比，肠镜的长度更长一些，管径更粗一点。此外，由于大肠是形成粪便及储存粪便的场所，为了更好的进行观察，检查前需要进行肠道准备，即服用专门的泻药及去泡剂，将大肠里的粪便排泄干净，同时减少气泡的产生，以便更易于发现病变。检查时间较胃镜稍长，但大多可以在20分钟内完成。普通肠镜检查过程中，部分患者可能会有胀痛的感觉，但多为暂时性的，大多数患者在检查结束后可完全缓解，不会对人体造成损害。产生不适的原因是因为在检查过程中，医生会向肠腔内注入些许空气以撑开肠壁，便于观察，同时，大肠在人体腹腔中的活动性大，解剖位置因人而异，肠镜在肠腔内走行，势必会刺激肠道，使人感到不适，但大多数人是可以耐受的。同样，对疼痛不适敏感的患者可以选择无痛肠镜检查。